میکروسکوپ فلورسنت

یک نمونه مناسب برای مشاهده در زیر میکروسکوپ فلورسنت، باید فلوئورسنت باشد. روش‌های بسیار زیادی به منظور تهیه یک نمونه فلوئورسنت وجود دارد.

این نوع میکروسکوپ در علوم زیستی ابزار قدرتمندی محسوب می‌شود و از آن برای بررسی توزیع پروتئین‌ها یا سایر مولکول‌ها در نمونه استفاده می گردد. به همین دلیل تکنیک‌های مختلفی برای رنگ آمیزی فلورسنت نمونه‌های زیستی ابداع شده‌است.

رنگ‌های فلورسنت بسیاری برای رنگ آمیزی مولکول‌های زیستی طراحی شده‌است. برخی از این رنگ‌ها مولکول‌های کوچکی هستند که ذاتاً فلوئورسنت اند و به مولکول زیستی مورد نظر می چسبند. از جمله این رنگ‌ها می‌توان به رنگ‌های مخصوص رنگ کردن نوکلئیک اسید از جمله رنگ DAPI و  Hoechst  اشاره کرد. همه این رنگ‌ها به شیار کوچک DNA یا همان minor groove متصل می‌شوند.